36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0119 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  807    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  43.05 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  30.67 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  34.76 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 414 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  24.7 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  26 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  29.87 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  26.95 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 		 519 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  23.53 
 
 		 449 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>