60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2386 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2386  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 357 aa  721    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  42.06 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  39.94 
 
 		 357 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  38.98 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.34 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2271  transcriptional regulator, TrmB  27.15 
 
 		 350 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2646  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4089  transcriptional regulator, TrmB  26.78 
 
 		 742 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1148  transcriptional regulator, TrmB  24.53 
 
 		 363 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0131  transcriptional regulator, TrmB  25.97 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0208  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.986438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0043  transcriptional regulator, TrmB  27.5 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0543  transcriptional regulator, TrmB  26.63 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0100454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  26.97 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  23.63 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1188  transcriptional regulator, TrmB  21.82 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0102771  hitchhiker  0.00221829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  24.06 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  24.73 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  24.06 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  23.11 
 
 		 261 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.08 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  24.02 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  23.79 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  38.81 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  23.63 
 
 		 261 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  44.26 
 
 		 275 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  24.46 
 
 		 261 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2763  transcriptional regulator, TrmB  47.46 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 268 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  22.62 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  45.61 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0183  hypothetical protein  26.19 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  28.85 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  37.89 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  25.3 
 
 		 260 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  42.11 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  25.44 
 
 		 223 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.21 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1582  transcriptional regulator, TrmB  33.68 
 
 		 267 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  36.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0762  transcriptional regulator-like protein  35.62 
 
 		 256 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.239824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  28.75 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0860  transcriptional regulator, TrmB  22.83 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  38.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  26.4 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  31.65 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 236 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 278 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>