More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2116 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
346 aa  696    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
388 aa  298  8e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.575298  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 
330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0131606  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
331 aa  286  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.426528  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
372 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.173212  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.67 
 
 
343 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
342 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
322 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.32423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
301 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20807  normal  0.604183 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0527807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
290 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.377446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5699  ABC transporter, permease  42.17 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
288 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.204889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1658  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.71 
 
 
302 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
344 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
282 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.951442  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.502248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.534309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1400  ABC transporter related  32.77 
 
 
638 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785888  normal  0.726008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  32.17 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
331 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0043  hypothetical protein  32.02 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.728589  normal  0.420247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  33.33 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 
279 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
280 aa  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0590918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
279 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1268  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease component  31.3 
 
 
279 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  33.76 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.76 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01330  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.08 
 
 
311 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
321 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000200943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.4 
 
 
727 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
325 aa  109  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
306 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
468 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
307 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
344 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  31.08 
 
 
307 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03425  hypothetical protein  27.45 
 
 
341 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
840 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
273 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141415  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1074  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 
464 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
350 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
331 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0878076  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
287 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
306 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
385 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
336 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002584  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 2  26.23 
 
 
341 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
279 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3009  ABC transporter related  27.08 
 
 
314 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.450322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
299 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.876873  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
277 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 
290 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00106936  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1069  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 
338 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.6 
 
 
284 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
310 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
260 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.83 
 
 
310 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2084  ABC transporter, permease  30.26 
 
 
293 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.741475 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
290 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2578  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  25.76 
 
 
341 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
309 aa  103  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.383419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
302 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  0.031338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4862  putative ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 
327 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400673  normal  0.659782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0912  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, permease components  28.32 
 
 
304 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
386 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
316 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13229 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.92 
 
 
299 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1613  oligopeptide ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
319 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
287 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
311 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
292 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
291 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00767174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.71 
 
 
318 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7183  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.96 
 
 
335 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
386 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
309 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
285 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>