More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5138 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
459 aa  919    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 
510 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.99 
 
 
501 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.46 
 
 
724 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
350 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
349 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
322 aa  204  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
330 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 
328 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 
347 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 
352 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 
338 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
349 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  38.54 
 
 
353 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
342 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
353 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
351 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
350 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
351 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
342 aa  187  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.42 
 
 
336 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.46 
 
 
342 aa  187  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.63 
 
 
346 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
342 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.87 
 
 
347 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
351 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.63 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.24 
 
 
344 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.37 
 
 
346 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  37.25 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.28 
 
 
337 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
353 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.01 
 
 
312 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
346 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 
340 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
312 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
368 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
312 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
342 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.31 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
325 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 
315 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
312 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
325 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
348 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  27.74 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
310 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
310 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  27.83 
 
 
313 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
345 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  29.01 
 
 
352 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
310 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
319 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
309 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
310 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
310 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
333 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
310 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.54 
 
 
314 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
321 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
309 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
312 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
309 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
327 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
328 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
306 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  27.43 
 
 
336 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
329 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  29.5 
 
 
336 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.34 
 
 
308 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
329 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
315 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.94 
 
 
309 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  28 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
305 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  29.13 
 
 
329 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
327 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3247  UDP-glucose 4-epimerase  27.68 
 
 
338 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  29.25 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
328 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
321 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
321 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  30.28 
 
 
327 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5588  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5636  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
310 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  35.25 
 
 
309 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  31.86 
 
 
320 aa  93.2  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  36.13 
 
 
335 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  27.76 
 
 
329 aa  93.2  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  26.1 
 
 
326 aa  93.2  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  31.09 
 
 
337 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>