71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3707 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  100 
 
 
149 aa  286  9e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  57.36 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  57.35 
 
 
137 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  49.66 
 
 
146 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  61.33 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  43.81 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  45.13 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  38.32 
 
 
135 aa  80.1  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  36.19 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  37.86 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  45.6 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  32.23 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.35 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  31.62 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  31.75 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  37.5 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  31.67 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  36.36 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  33.33 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  30.89 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  37.39 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  32.5 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  29.06 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.65 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  26.67 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1986  DoxX family protein  35.09 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  31.34 
 
 
236 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  26.83 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3522  DoxX family protein  32.35 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0254213  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  32.17 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  30.08 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  34.19 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32.28 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  36.54 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  29.41 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  31.2 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1786  DoxX family protein  34.21 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  31.15 
 
 
174 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  28.21 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  27.42 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3227  DoxX family protein  33 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374067  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  43.36 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  27.42 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2109  DoxX  33.06 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  30.08 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4540  membrane protein, DoxX  34.29 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2855  DoxX family protein  30.17 
 
 
379 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  30.91 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.21 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  30.33 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  33.98 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  29.92 
 
 
226 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  30.33 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0868  DoxX family protein  33.66 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.879404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  26.32 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  32.31 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  33.05 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  29.35 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  28.97 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  31.09 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  27.97 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  34.94 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1701  DoxX family protein  34.57 
 
 
174 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00286745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  27.19 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2341  DoxX  30.47 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201028  normal  0.120907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  33.73 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5807  DoxX family protein  31.76 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  30.56 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  27.48 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1308  DoxX family protein  35.14 
 
 
148 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.369686  normal  0.451433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>