More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3265 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1397  UvrD/REP helicase  91.28 
 
 		 621 aa  1144    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.036127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3265  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 624 aa  1269    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1443  UvrD/REP helicase  73.79 
 
 		 613 aa  892    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.20134  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0203  UvrD/REP helicase  73.68 
 
 		 614 aa  925    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0556  UvrD/REP helicase  72.13 
 
 		 613 aa  909    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128022  normal  0.315576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  22.56 
 
 		 666 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.69 
 
 		 841 aa  92.8  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.92 
 
 		 735 aa  91.7  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  21.84 
 
 		 708 aa  87.4  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.21 
 
 		 768 aa  87  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.25 
 
 		 724 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1416  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.6 
 
 		 664 aa  87  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1226  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  21.8 
 
 		 664 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305357  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  22.21 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 666 aa  84.7  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.56 
 
 		 678 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  26.82 
 
 		 720 aa  84  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 730 aa  84  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  25.72 
 
 		 720 aa  84  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  26.82 
 
 		 720 aa  83.6  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  23.54 
 
 		 668 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.65 
 
 		 743 aa  83.2  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 720 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.91 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 760 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  23.72 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  27.94 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.94 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  23.72 
 
 		 723 aa  82  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 817 aa  81.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.66 
 
 		 751 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.51 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.29 
 
 		 781 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  24.81 
 
 		 724 aa  81.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.29 
 
 		 781 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  22.48 
 
 		 807 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.19 
 
 		 751 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  23.85 
 
 		 730 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 672 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  25.07 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.27 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  23.89 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  23.83 
 
 		 723 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  27.69 
 
 		 720 aa  78.2  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  26.32 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 812 aa  77.4  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  23.09 
 
 		 674 aa  77.4  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  23.59 
 
 		 728 aa  77  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  27.54 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.62 
 
 		 694 aa  77  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  21.8 
 
 		 770 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.21 
 
 		 721 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  23.68 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  24.18 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.17 
 
 		 638 aa  75.1  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  24.82 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.4 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2848  UvrD/REP helicase  23.08 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.385626  normal  0.424075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  24.82 
 
 		 728 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  24.02 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  22.89 
 
 		 712 aa  74.7  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.03 
 
 		 849 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  19.55 
 
 		 597 aa  74.7  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  20.35 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.32 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.87 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.72 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.36 
 
 		 662 aa  73.9  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 726 aa  73.9  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 708 aa  73.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.62 
 
 		 670 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.22 
 
 		 659 aa  73.2  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2436  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000724075  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 1032 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  25.9 
 
 		 735 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  21.93 
 
 		 621 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  25.48 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.4 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>