More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09300 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  44.1 
 
 
243 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.3 
 
 
253 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  43.59 
 
 
243 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  43.59 
 
 
243 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  43.59 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.73 
 
 
251 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  43.08 
 
 
243 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.59 
 
 
243 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  43.08 
 
 
243 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  42.56 
 
 
243 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.83 
 
 
269 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.11 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  42.05 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  42.05 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.56 
 
 
243 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.79 
 
 
234 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.68 
 
 
212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.76 
 
 
176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.42 
 
 
206 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.93 
 
 
212 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4024  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.96 
 
 
222 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0116599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.82 
 
 
210 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.53 
 
 
213 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.97 
 
 
205 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.05 
 
 
121 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.05 
 
 
121 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.11 
 
 
126 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.9 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  35.62 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.58 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.72 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
117 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.15 
 
 
118 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.59 
 
 
118 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.64 
 
 
118 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.65 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.65 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.65 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.14 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.85 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.2 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.54 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.54 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  38.89 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.09 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  32.17 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.89 
 
 
120 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.27 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  67  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  46.27 
 
 
139 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.75 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.78 
 
 
527 aa  65.5  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.3 
 
 
147 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.93 
 
 
132 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.89 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.82 
 
 
133 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.77 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.75 
 
 
120 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.51 
 
 
120 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.51 
 
 
110 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54 
 
 
114 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.1 
 
 
120 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.44 
 
 
159 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4246  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.91 
 
 
115 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.87 
 
 
139 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.08 
 
 
151 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  39.44 
 
 
236 aa  61.6  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.8 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  32.8 
 
 
139 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  38.03 
 
 
283 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.06 
 
 
144 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  34.51 
 
 
119 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  43.75 
 
 
132 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  36.36 
 
 
141 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  31.71 
 
 
118 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
109 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.4 
 
 
138 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.75 
 
 
132 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  32 
 
 
138 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
139 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  31.75 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  33.9 
 
 
143 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  31.45 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  37.11 
 
 
125 aa  60.1  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.61 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.87 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.07 
 
 
121 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.13 
 
 
130 aa  59.3  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.89 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32 
 
 
139 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.4 
 
 
139 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.4 
 
 
139 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  31.71 
 
 
154 aa  59.3  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>