More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5402 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  30.73 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.29 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0176  SNARE associated Golgi protein  35.45 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292267  normal  0.98297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.31 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  28.8 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.49 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0187  DedA  36.02 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0175955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  24.76 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0167  hypothetical protein  36.25 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.951703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  28.21 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0176  DedA  35.4 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.53 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  26.96 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  28.71 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  29.29 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  29.28 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.26 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  26.77 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  29.27 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  24.47 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.59 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  24.04 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  27.36 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.88 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  25.82 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  28.3 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  27.5 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  30.12 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  28.74 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.49 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  23.39 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  24.65 
 
 
219 aa  61.6  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 
203 aa  61.6  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.77 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  26.47 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.38 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  21.76 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.71 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  21.76 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.62 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  24.04 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  26.42 
 
 
200 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  23.08 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  22.47 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  25.3 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  22.93 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  25.48 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.79 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.21 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  25.6 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  25 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  31.58 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  27.33 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  26.57 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  27.22 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  23.98 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  23.6 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  27.84 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  22.67 
 
 
204 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  25.39 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  26.42 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  26.42 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  26.42 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  26.42 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  26.42 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  25.28 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  28.26 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  28.24 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  25.81 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4294  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4272  SNARE associated Golgi protein  30.9 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  25.46 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  27.46 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0884  SNARE associated Golgi protein  22.33 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.38 
 
 
676 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  24.32 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  24.77 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  25.34 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  29.93 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 
200 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  22.97 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  23.53 
 
 
204 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
201 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  24.86 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  26.75 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  26.2 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  25.84 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>