275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1374 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  67.31 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  57.75 
 
 		 214 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  57.48 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  56.87 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  56.07 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  49.07 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.83 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  27.23 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.77 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  30.1 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.82 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  25.64 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  25.51 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.36 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  26.96 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.32 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  25.89 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  31.41 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.15 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  26.16 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.21 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  25.13 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  22.8 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  27.18 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.55 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  28.1 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  25.45 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  24.42 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.55 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  23.68 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.98 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  24.26 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0736  alkaline phosphatase  31.29 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  23.88 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  26.77 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  23.88 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.15 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4284  SNARE associated Golgi protein  28.25 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.747382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  22.07 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  24.08 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  23.08 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  24.02 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  24.41 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  23.53 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.02 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  28.74 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  23.6 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  28.74 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  28.74 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  27.96 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  25.41 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0807  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.43 
 
 		 664 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.568795  normal  0.843348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  27.34 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  25.4 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  23.04 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  28.22 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  20.81 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  24.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  27.78 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  27.78 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  27.78 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  27.51 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  28.24 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  24.73 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.24 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  27.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.32 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  26.54 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  27.16 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  23.53 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  23.53 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  22.99 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  24.47 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  24.87 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.12 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  25.16 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.81 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3035  SNARE associated Golgi protein  30.45 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  25.49 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4141  hypothetical protein  27.11 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.754681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  23.94 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>