194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1436 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  59.35 
 
 
214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  53.49 
 
 
214 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  57.48 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  49.07 
 
 
215 aa  197  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  49.3 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  50.23 
 
 
214 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.16 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  27.46 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  30.68 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  25.14 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.32 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  26.67 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  25.79 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  28.57 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.72 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.4 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  27.32 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.4 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.55 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  28.92 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  26.02 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  26.63 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  25.82 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  26.05 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  31.73 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  31.73 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3417  inner membrane protein YqjA  31.73 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.42 
 
 
202 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  31.25 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  26.56 
 
 
198 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3414  inner membrane protein YqjA  31.25 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  30.73 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0606  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3266  putative inner membrane protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4410  putative inner membrane protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0601  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.29 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  27.67 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  24.77 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.04 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  25.91 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  31.28 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  29.81 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  24.21 
 
 
266 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  24.87 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  24.21 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  26.75 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  25 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25.65 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  28.1 
 
 
241 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  32.7 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  24.64 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.26 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.51 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  23.21 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  30.34 
 
 
678 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  30.34 
 
 
678 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  22.55 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  23.94 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  27.32 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  23.44 
 
 
202 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  24.48 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.24 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  26.35 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  23.3 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  24.23 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  22.01 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  22.01 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  24.86 
 
 
205 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0334  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 
196 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  22.22 
 
 
201 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 
199 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.88 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  24.76 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.14 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  21.67 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  22.96 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  24.1 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.08 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.75 
 
 
682 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  27.75 
 
 
682 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  24.71 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  24.71 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  23.67 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  24.71 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>