250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1189 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  71.56 
 
 		 214 aa  287  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  70.89 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  57.75 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  59.43 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  59.35 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  53.55 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.56 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  29.38 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.25 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  26.42 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.45 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.67 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.8 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  27.13 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  29.65 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  25.59 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4284  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.747382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.76 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  25.47 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.5 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.74 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  25.24 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  25.12 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  27.44 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  29.15 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  26.47 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.38 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.34 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  27.47 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.38 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.16 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.78 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  28.3 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  25.81 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  25.82 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  25.82 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0736  alkaline phosphatase  29.05 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  25.48 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  25.27 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0526  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  25.27 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.96 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0743  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.44 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0026  DedA family protein  30.06 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  24.57 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  24.73 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  25.63 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  24.73 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  23.04 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  27.6 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  24.59 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  25.52 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  28.3 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  25 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  25 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  23.53 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  23.63 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  25 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.64 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  26.99 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  24.08 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  24.41 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  23.63 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0487  hypothetical protein  30.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000202069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.71 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  24.59 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  23.37 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1108  hypothetical protein  30.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00139496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  26.67 
 
 		 682 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0550  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  24.59 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 682 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  23.7 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  25.16 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  28.11 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  24.05 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  23.98 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.15 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  24.74 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4325  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  24.18 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  22.83 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3388  SNARE associated Golgi protein  27.93 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.65 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  26.84 
 
 		 678 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>