236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1183 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  70.89 
 
 		 214 aa  307  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  71.56 
 
 		 214 aa  294  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  57.48 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  58.29 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  60.75 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  57.48 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.92 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.22 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  26.6 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  27.46 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  33.73 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  23.47 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  25.35 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  27.71 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  26.49 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  27.89 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  26.06 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  25.14 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  26.52 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  26.52 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.57 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  27.44 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  29.55 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  26.42 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  25.93 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  24.46 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  24.46 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5402  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.69 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  23.91 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  23.91 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  23.91 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  27.81 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  26.94 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  29.65 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  26.92 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.51 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  25.31 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  25.53 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  27.95 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  26.6 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.27 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.23 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  26.06 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  26.06 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2571  DedA family protein  24.86 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  26.06 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  30.93 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  26.06 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.57 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  25 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  26.6 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  30.19 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  27.57 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  27.45 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  27.45 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  27.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  26.06 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1898  SNARE associated Golgi protein  25.43 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  25.43 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  26.4 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  27.81 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  25.53 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.62 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.8 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  28.71 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  28.71 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  31.01 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  22.65 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0536  alkaline phosphatase  25.64 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  22.95 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  28.88 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  26.82 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  22.95 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  26.14 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4284  SNARE associated Golgi protein  26.47 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.747382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  22.95 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.06 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  27.91 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  28.92 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.86 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  24.77 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.6 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2468  SNARE associated Golgi protein  23.9 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.663363  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  23.43 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0187  DedA  32.22 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0175955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4294  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>