More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3293 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3293  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.214726  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  37.75 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  38.41 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  38.41 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  37.75 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  37.75 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  43.18 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  42.94 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  38.41 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  38.41 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  38.41 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  38.51 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  38.51 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  38.51 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  39.19 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  38.41 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  41.55 
 
 		 374 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  37.75 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  34.81 
 
 		 366 aa  91.3  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  42.64 
 
 		 378 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  40.94 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  31.34 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  29.84 
 
 		 300 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  33.73 
 
 		 343 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  32 
 
 		 325 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  41.22 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  30.9 
 
 		 354 aa  88.6  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  35.56 
 
 		 349 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  35.48 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  34.81 
 
 		 349 aa  87  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  35.82 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  35.82 
 
 		 357 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  30.89 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  30.37 
 
 		 367 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  29.47 
 
 		 417 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  34.68 
 
 		 312 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  32.34 
 
 		 349 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  29.32 
 
 		 391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  34.76 
 
 		 310 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  34.75 
 
 		 391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  34.75 
 
 		 391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  34.75 
 
 		 391 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  31.55 
 
 		 355 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  35.07 
 
 		 248 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  36.84 
 
 		 349 aa  85.9  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  35.07 
 
 		 248 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  37.31 
 
 		 367 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  35.07 
 
 		 248 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  35.07 
 
 		 248 aa  85.5  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  34.33 
 
 		 248 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  35.07 
 
 		 248 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  34.04 
 
 		 406 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  31.74 
 
 		 349 aa  85.1  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  34.81 
 
 		 367 aa  84.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  34.81 
 
 		 367 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  34.81 
 
 		 459 aa  84.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 383 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  29.47 
 
 		 280 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  34.81 
 
 		 367 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  29.47 
 
 		 359 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  36.57 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1766  peptide chain release factor 2  36.3 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.015531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  34.36 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  36.57 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  36.57 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21873  predicted protein  32.46 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  36.57 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  36.6 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  35.38 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  34.97 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  28.65 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1645  peptide chain release factor 2  35.76 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  40.62 
 
 		 372 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  31.79 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  38.64 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  34.44 
 
 		 364 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  34.44 
 
 		 362 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  35.14 
 
 		 369 aa  81.3  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  31.95 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  36.18 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  32.92 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  36.57 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0182  peptide chain release factor 2  36.3 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1303  LigA  34.44 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.082327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  42.86 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  41.01 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  41.41 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  37.16 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  37.65 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf295  peptide chain release factor 1  33.87 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.410445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  35.56 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0328  peptide chain release factor 2  29.38 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  36.57 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  34.19 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  45.19 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  42.11 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  34.33 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01981  peptide chain release factor 2  36.23 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0513147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>