44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0876 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  100 
 
 		 843 aa  1642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6300  hypothetical protein  42.81 
 
 		 573 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  41.79 
 
 		 491 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2759  hypothetical protein  40.07 
 
 		 331 aa  164  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.645738  hitchhiker  0.00620663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  59.62 
 
 		 544 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  61.54 
 
 		 548 aa  66.6  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.01 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.47 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  37.69 
 
 		 322 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.05 
 
 		 1707 aa  61.6  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.61 
 
 		 420 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  37.7 
 
 		 671 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6181  peptidase domain protein  40.98 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.729562  normal  0.0122483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.47 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.66 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 456 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 440 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.88 
 
 		 294 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1987 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.13 
 
 		 374 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 		 487 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.95 
 
 		 429 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.06 
 
 		 320 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0527  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 235 aa  52  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.265786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  43.97 
 
 		 259 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 314 aa  50.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  46 
 
 		 1918 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 		 623 aa  48.5  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  29.27 
 
 		 823 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  33.7 
 
 		 428 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  37.37 
 
 		 290 aa  47.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 3662 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.13 
 
 		 412 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  39.44 
 
 		 380 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1062  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 407 aa  45.8  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 386 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  35.9 
 
 		 490 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  39.33 
 
 		 2848 aa  44.3  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 		 417 aa  44.3  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  33.83 
 
 		 1335 aa  44.3  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  25.56 
 
 		 2062 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>