240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2154 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  56.64 
 
 		 232 aa  261  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  47.83 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  52.16 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.86 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  52.81 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  51.28 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  49.35 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  53.3 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  49.35 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 268 aa  215  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 229 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  50.65 
 
 		 225 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  48.66 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  49.14 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  52.81 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.77 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  50.65 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  58.29 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  47.41 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  48.05 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  47.75 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  47.75 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  48.88 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  46.75 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  46.4 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  47.79 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50.74 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  47.51 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  49.57 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  48.43 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  49.32 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  50.49 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  50.44 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  51.43 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  52.16 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>