More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1936 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  43.47 
 
 		 817 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  43.15 
 
 		 823 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  46.11 
 
 		 830 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  43.29 
 
 		 814 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  41.9 
 
 		 850 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  46.6 
 
 		 794 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  46.6 
 
 		 794 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  43.66 
 
 		 814 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  43.31 
 
 		 817 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  41.9 
 
 		 850 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  45.27 
 
 		 814 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  43 
 
 		 815 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  44.5 
 
 		 803 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  46.89 
 
 		 793 aa  676    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  48.58 
 
 		 804 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  42.89 
 
 		 817 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  42.02 
 
 		 850 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  42.02 
 
 		 850 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  41.61 
 
 		 846 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 790 aa  1625    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.33 
 
 		 817 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  43.47 
 
 		 817 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  44.02 
 
 		 819 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  42.91 
 
 		 823 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  42.14 
 
 		 850 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  46.29 
 
 		 793 aa  674    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  41.91 
 
 		 850 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  41.53 
 
 		 850 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  42.21 
 
 		 814 aa  635  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  41.53 
 
 		 850 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  41.41 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  41.41 
 
 		 850 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  41.41 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  41.41 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  41.41 
 
 		 850 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  46.75 
 
 		 800 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  46.65 
 
 		 803 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  41.29 
 
 		 858 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  43.31 
 
 		 852 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  41.55 
 
 		 851 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  41.84 
 
 		 851 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  41.55 
 
 		 851 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  41.84 
 
 		 851 aa  619  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  42.1 
 
 		 852 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  41.84 
 
 		 851 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  41.66 
 
 		 851 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 		 843 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  44.91 
 
 		 791 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  39.65 
 
 		 861 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  41.77 
 
 		 846 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  40.6 
 
 		 839 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  40.95 
 
 		 839 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  40.6 
 
 		 839 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  42.25 
 
 		 777 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  40.6 
 
 		 839 aa  595  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  42.6 
 
 		 771 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  44.24 
 
 		 779 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  41.1 
 
 		 835 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  41.14 
 
 		 825 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  41.02 
 
 		 839 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  40.68 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  40.68 
 
 		 844 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  44.38 
 
 		 794 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  40.34 
 
 		 844 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  40.56 
 
 		 847 aa  587  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  39.56 
 
 		 865 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  40.22 
 
 		 849 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 		 793 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  43.9 
 
 		 797 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  40.81 
 
 		 822 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  44.76 
 
 		 824 aa  581  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 		 839 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  38.71 
 
 		 846 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  44.43 
 
 		 799 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  39.15 
 
 		 855 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  39.98 
 
 		 885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  45.11 
 
 		 777 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  44.97 
 
 		 777 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  42.9 
 
 		 797 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  39.34 
 
 		 863 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  44.07 
 
 		 799 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  41.29 
 
 		 807 aa  570  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  43.98 
 
 		 801 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  43.76 
 
 		 766 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  44.01 
 
 		 796 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  43.8 
 
 		 797 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  42.02 
 
 		 854 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  43.28 
 
 		 792 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  42.7 
 
 		 778 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  43.36 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  42.02 
 
 		 809 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  38.42 
 
 		 851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  43.94 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  42.51 
 
 		 805 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>