More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1228 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1228  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 133 aa  270  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  68.99 
 
 		 386 aa  184  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  64.62 
 
 		 388 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  52.71 
 
 		 387 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  56.49 
 
 		 389 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  51.67 
 
 		 387 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  47.33 
 
 		 391 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  46.15 
 
 		 383 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  46.15 
 
 		 383 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  49.59 
 
 		 383 aa  124  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  52.67 
 
 		 388 aa  124  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  51.2 
 
 		 382 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  48.36 
 
 		 383 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  51.2 
 
 		 395 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  46.46 
 
 		 386 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  46.4 
 
 		 381 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.33 
 
 		 383 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  48.33 
 
 		 383 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  51.2 
 
 		 385 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  47.5 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  47.5 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  47.5 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  47.5 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  47.5 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  50.4 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  48.33 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  41.86 
 
 		 381 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  45.9 
 
 		 383 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  45.38 
 
 		 389 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  45.38 
 
 		 387 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  51.24 
 
 		 380 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  45.38 
 
 		 387 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  50.41 
 
 		 380 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  50.41 
 
 		 380 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  43.44 
 
 		 383 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  50.41 
 
 		 384 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  49.18 
 
 		 380 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  49.59 
 
 		 383 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  47.2 
 
 		 388 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  45.6 
 
 		 378 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  46.34 
 
 		 378 aa  106  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3920  acetylornithine deacetylase  48.78 
 
 		 383 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0194  acetylornithine deacetylase  48 
 
 		 382 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  47.54 
 
 		 383 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  49.6 
 
 		 382 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  42.52 
 
 		 382 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  45 
 
 		 383 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  40.46 
 
 		 379 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  47.52 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  45.74 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0331  acetylornithine deacetylase (ArgE)  48.42 
 
 		 388 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  44.8 
 
 		 378 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  42.34 
 
 		 374 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  45.61 
 
 		 391 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  37.9 
 
 		 389 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.74 
 
 		 391 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  40 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  41.96 
 
 		 388 aa  74.7  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  36.59 
 
 		 387 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  38.38 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  41.12 
 
 		 384 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  39.5 
 
 		 384 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.79 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  39.5 
 
 		 384 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  41.67 
 
 		 385 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  41.74 
 
 		 403 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.3 
 
 		 402 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  39.58 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  40.35 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  40.83 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  42.48 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  45.16 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  45.16 
 
 		 390 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  41.76 
 
 		 390 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  42.55 
 
 		 397 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  41.18 
 
 		 374 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  40.87 
 
 		 376 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  44.33 
 
 		 389 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  42.16 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  36.67 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  43.68 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.3 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  54.84 
 
 		 400 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  38.6 
 
 		 387 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  42.48 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  37.17 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  38.6 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.8 
 
 		 413 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  38.89 
 
 		 398 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  39.56 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  43.62 
 
 		 386 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  38.71 
 
 		 385 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.04 
 
 		 389 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.82 
 
 		 381 aa  67.8  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>