More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0999 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
316 aa  627  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  58.52 
 
 
306 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  59.54 
 
 
302 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  60.75 
 
 
335 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  51.17 
 
 
300 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50.67 
 
 
297 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  48.16 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  48.16 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
325 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  49.33 
 
 
329 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  51.55 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  51.21 
 
 
332 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  49.69 
 
 
337 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  48.82 
 
 
320 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  52.43 
 
 
320 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  52.78 
 
 
339 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  47.59 
 
 
309 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 
314 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  50.7 
 
 
322 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  50.7 
 
 
322 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  46.75 
 
 
372 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  47.21 
 
 
309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  46.43 
 
 
307 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  46.1 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 
329 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  49.29 
 
 
366 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  52.45 
 
 
318 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 
336 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  49.14 
 
 
329 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 
328 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  49.31 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 
313 aa  245  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  51.71 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
373 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 
319 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  46.85 
 
 
324 aa  238  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  49.65 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  48.23 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 
333 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  42.86 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 
314 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 
311 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.69 
 
 
299 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  38.75 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  40.42 
 
 
305 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  38.41 
 
 
296 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  39.02 
 
 
299 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.12 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.35 
 
 
299 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.26 
 
 
304 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  32.8 
 
 
299 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 
305 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 
326 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.12 
 
 
299 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.58 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  32.8 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.58 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.35 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 
327 aa  182  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.01 
 
 
299 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  40.88 
 
 
299 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.92 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.88 
 
 
295 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.27 
 
 
331 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.67 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.67 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  35.81 
 
 
312 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  35.81 
 
 
312 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.17 
 
 
334 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.81 
 
 
312 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 
305 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 
305 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 
312 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
313 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 
299 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 
342 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.18 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  37.07 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 
307 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 
398 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.33 
 
 
300 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 
326 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
300 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 
317 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  35.55 
 
 
342 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 
340 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  33.69 
 
 
309 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.09 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.25 
 
 
314 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>