More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0635 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00193  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1038  prolyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 572 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0147729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  61.48 
 
 		 571 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0206  prolyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 572 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.835118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 564 aa  671    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2013  prolyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 583 aa  691    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 571 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 574 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 581 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3230  prolyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 569 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 571 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 571 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 570 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3988  prolyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 571 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 580 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1727  prolyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 		 564 aa  649    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  58.08 
 
 		 569 aa  686    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 569 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 		 571 aa  710    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0429  prolyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 572 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 576 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 578 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 572 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 573 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 		 568 aa  717    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 579 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 571 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 566 aa  670    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 574 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1197  prolyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 571 aa  705    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 578 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 578 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 569 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 584 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 578 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 569 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 572 aa  704    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 578 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1091  prolyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 572 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3758  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  686    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000162237  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 569 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 571 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 578 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 571 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 582 aa  639    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 570 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0909  Pectate lyase/Amb allergen  59.3 
 
 		 575 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000725309  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 573 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 578 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 571 aa  689    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 571 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 573 aa  688    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 571 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0463  prolyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 572 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178394  normal  0.888512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3100  prolyl-tRNA synthetase  57.12 
 
 		 573 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 580 aa  653    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 578 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3410  prolyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 572 aa  674    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 571 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 578 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1305  prolyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 571 aa  677    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.30482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 570 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 570 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 568 aa  717    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2753  prolyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 571 aa  687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00193635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 571 aa  698    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 570 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  56.27 
 
 		 578 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 571 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0751  prolyl-tRNA synthetase  57.61 
 
 		 576 aa  665    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2338  prolyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 574 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 570 aa  675    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03253  prolyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 571 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 578 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 572 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3061  prolyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 574 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 570 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0400  prolyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 571 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0189539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 572 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  58.27 
 
 		 578 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 572 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 571 aa  692    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 571 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 581 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  60.21 
 
 		 577 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>