More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2404 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  77.28 
 
 
439 aa  675    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  72.77 
 
 
449 aa  636    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  76.92 
 
 
433 aa  671    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  78.07 
 
 
433 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
436 aa  872    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  48.79 
 
 
413 aa  383  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  46.29 
 
 
436 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2447  GTP-binding proten HflX  43.71 
 
 
469 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  38.07 
 
 
424 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  35.8 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  34.55 
 
 
409 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  36.41 
 
 
425 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.96 
 
 
422 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  35.68 
 
 
371 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  34.77 
 
 
419 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  33.64 
 
 
419 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  38.44 
 
 
433 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36.88 
 
 
434 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  34.29 
 
 
419 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  34.53 
 
 
419 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  33.87 
 
 
419 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  33.64 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.09 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  34.24 
 
 
419 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  34.24 
 
 
419 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  36.87 
 
 
431 aa  199  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  34.52 
 
 
597 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  35.98 
 
 
582 aa  199  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  34.99 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  34.27 
 
 
597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  38.01 
 
 
434 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  34.18 
 
 
419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  37.12 
 
 
433 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  39.39 
 
 
433 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  37.24 
 
 
435 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  37.78 
 
 
403 aa  192  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  37.18 
 
 
385 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  36.58 
 
 
421 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  36 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  36.93 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  35.64 
 
 
419 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.47 
 
 
493 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  37.5 
 
 
487 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  35.51 
 
 
437 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  34.82 
 
 
375 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  36.73 
 
 
482 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  36.66 
 
 
493 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1623  GTP-binding proten HflX  35.9 
 
 
408 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  36.14 
 
 
444 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  36.62 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  36.39 
 
 
406 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  35.56 
 
 
437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  37.21 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  37.07 
 
 
414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  37.54 
 
 
530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.75 
 
 
441 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  36.16 
 
 
434 aa  182  7e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  32.36 
 
 
421 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 
461 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  35.75 
 
 
485 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  34.39 
 
 
553 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  34.23 
 
 
522 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  36.62 
 
 
372 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  37.01 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  37.47 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  35.01 
 
 
429 aa  180  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  35.78 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  36.69 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  37.04 
 
 
509 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  33.64 
 
 
519 aa  179  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  34.91 
 
 
501 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  35.07 
 
 
494 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  34.61 
 
 
420 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  37 
 
 
503 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  35.37 
 
 
436 aa  176  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  36.48 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  36.62 
 
 
392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  34.9 
 
 
515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  36.91 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  35.31 
 
 
501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  35.34 
 
 
521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  36.36 
 
 
517 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  35.47 
 
 
454 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.9 
 
 
486 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  34.05 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  34.89 
 
 
553 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  33.42 
 
 
423 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  32.47 
 
 
509 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  36.08 
 
 
395 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  35.88 
 
 
502 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  34.16 
 
 
450 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  35.64 
 
 
441 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  35.7 
 
 
512 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  34.37 
 
 
474 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  34.09 
 
 
435 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  36.97 
 
 
442 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  33.75 
 
 
512 aa  170  4e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  37.74 
 
 
424 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  37.74 
 
 
354 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  37.39 
 
 
564 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>