More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0139 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
409 aa  819    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  49.06 
 
 
381 aa  336  5e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  48.44 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  47.12 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  46.22 
 
 
372 aa  323  4e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  49.66 
 
 
424 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  38.1 
 
 
436 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  37.84 
 
 
433 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  34.55 
 
 
436 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  36.91 
 
 
449 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  37.72 
 
 
405 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  38.32 
 
 
435 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  39.03 
 
 
487 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  34.79 
 
 
371 aa  202  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  37.35 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  37.5 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  38.99 
 
 
414 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  38.99 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  37.67 
 
 
434 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  36.6 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  36.01 
 
 
441 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  35.9 
 
 
489 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  34.99 
 
 
439 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  37.01 
 
 
434 aa  193  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  35.61 
 
 
489 aa  193  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  35.12 
 
 
461 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  34.88 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  34.88 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  34.88 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  35.78 
 
 
417 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  35.73 
 
 
385 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  35.85 
 
 
429 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  34.45 
 
 
432 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  36.57 
 
 
433 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  35.23 
 
 
433 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  34.9 
 
 
433 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  35.16 
 
 
433 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  36.11 
 
 
412 aa  187  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  34.62 
 
 
429 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  35.45 
 
 
441 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.97 
 
 
436 aa  186  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  34.15 
 
 
440 aa  186  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  37.36 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.99 
 
 
441 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  35.1 
 
 
431 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  35.16 
 
 
433 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  39.12 
 
 
442 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  34.34 
 
 
429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  36.18 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40.23 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  34.07 
 
 
429 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  36.93 
 
 
395 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
392 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  36.65 
 
 
396 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  34.49 
 
 
512 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  36.36 
 
 
395 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
392 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  35.82 
 
 
350 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  36.36 
 
 
396 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  36.36 
 
 
395 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  36.75 
 
 
387 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  36.36 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  35.8 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  33.52 
 
 
481 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  34.37 
 
 
502 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  36.41 
 
 
434 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  37.5 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.34 
 
 
406 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  36.16 
 
 
384 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  35.2 
 
 
564 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  35.29 
 
 
564 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  36.83 
 
 
460 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  35.41 
 
 
382 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  37.87 
 
 
405 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  34.69 
 
 
428 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  37.78 
 
 
439 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  34.44 
 
 
436 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  35.1 
 
 
482 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  33.8 
 
 
435 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  34.25 
 
 
430 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  34.64 
 
 
445 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  33.33 
 
 
495 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  34.09 
 
 
432 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  35.56 
 
 
433 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  35.69 
 
 
404 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  33.33 
 
 
439 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  35.69 
 
 
404 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  36.49 
 
 
450 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.1 
 
 
420 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  34.02 
 
 
553 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  34.66 
 
 
432 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  36.29 
 
 
433 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0602  GTP-binding protein HflX  35.77 
 
 
389 aa  176  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.406819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  34.2 
 
 
535 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  34.38 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>