More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3123 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 474 aa  942    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  59.56 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  58.93 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  57.83 
 
 		 441 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  57.67 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  57.08 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  57.97 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  57.91 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  57.05 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  55.88 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  55.07 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  55.07 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  54.63 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  57.05 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  58.82 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  57.56 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  55.35 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  54.98 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  57.53 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  57.39 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  54.3 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  50.45 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  57.7 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  54.55 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  54.32 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  57.42 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  54.65 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  58.03 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  56.05 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  53.41 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  56.05 
 
 		 416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.97 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.61 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  57.41 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  56.83 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  58.54 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  55.05 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.86 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  54.87 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  54.05 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  51.5 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  53.12 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  51.51 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.92 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.85 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  47.46 
 
 		 454 aa  299  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  46.95 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  43.53 
 
 		 440 aa  295  9e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.94 
 
 		 421 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  51.69 
 
 		 417 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.72 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.72 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  49.72 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.47 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  48.12 
 
 		 441 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.41 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.41 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  43.34 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  48.68 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  50.8 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.03 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.97 
 
 		 432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.28 
 
 		 436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  50.48 
 
 		 414 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.41 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.05 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.89 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  50.73 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  45.8 
 
 		 454 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  45.8 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  42.76 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  45.26 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  47.21 
 
 		 439 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  47.11 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  42.96 
 
 		 450 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.89 
 
 		 421 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.57 
 
 		 426 aa  277  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0580  GTP-binding protein hflX  44.41 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.57 
 
 		 426 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  44.44 
 
 		 435 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  47.63 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  45.5 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  45.5 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.49 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  45.26 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.47 
 
 		 429 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.09 
 
 		 431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  45.92 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.47 
 
 		 439 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.09 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  45.24 
 
 		 435 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  41.83 
 
 		 426 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  41.83 
 
 		 426 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>