More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1605 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  100 
 
 		 371 aa  758    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  40.45 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  38.66 
 
 		 439 aa  235  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  41.36 
 
 		 424 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  35.68 
 
 		 436 aa  222  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  37.2 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  37.8 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  37.46 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  36.16 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  37.75 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  34.79 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  38.32 
 
 		 436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  36.44 
 
 		 433 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  33.43 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  32.95 
 
 		 454 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  34 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  36.05 
 
 		 434 aa  183  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  36.08 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  36.08 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  36.08 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  35.65 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  33.52 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  37.07 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  35.04 
 
 		 441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  34.71 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  37.5 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  33.05 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  34.84 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  33.96 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  33.8 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  35.56 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  36.13 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  34.48 
 
 		 441 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  35.24 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  37.42 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  36.81 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  34.82 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  35.35 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  34.1 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  33.05 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  32.42 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  33.15 
 
 		 432 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  35.53 
 
 		 429 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.24 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  35.76 
 
 		 437 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  32.66 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  33.24 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  34.5 
 
 		 434 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  35.17 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  32.47 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  33.7 
 
 		 569 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  34.58 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  32.18 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  34.32 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  33.04 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  34.65 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  31.9 
 
 		 419 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  32.08 
 
 		 419 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  35.39 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  32.68 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  32.58 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  31.9 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  32.74 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  32.08 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  31.49 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  31.9 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  35.05 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  37.62 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  31.9 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  33.87 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  31.49 
 
 		 435 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  34.27 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  31.22 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  32.31 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  33.33 
 
 		 429 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  34.62 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  37.3 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  31.22 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  33.88 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  37.62 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  32.45 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  35.21 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  31.44 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  33.76 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  34.62 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  37.3 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  34.62 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  31.22 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  32.97 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  34.62 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  34.62 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.92 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  31.13 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  33.72 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  34.62 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  33.44 
 
 		 419 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>