More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1333 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  100 
 
 		 515 aa  1012    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0929  histidine kinase  41.22 
 
 		 564 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1800  histidine kinase  31.47 
 
 		 588 aa  97.8  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 729 aa  93.2  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 578 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 1052 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  32.51 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0178  histidine kinase  27.95 
 
 		 557 aa  77.4  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.283442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2243  histidine kinase  28.38 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.312206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0028  histidine kinase  28.83 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.801683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2850  histidine kinase  27.51 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2186  histidine kinase  29.14 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  32.11 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2385  histidine kinase  28.79 
 
 		 337 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.665277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3664  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 708 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1743  histidine kinase  32.14 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1570  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138463  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 739 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 858 aa  67.4  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0175  histidine kinase  24.67 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0979792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 475 aa  64.7  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2923  histidine kinase  32.1 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0771674  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0919  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000529164 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  27.13 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 440 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0421  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.410196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2120  histidine kinase  31.42 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.238176  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2626  hypothetical protein  38.24 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.817414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0103276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 753 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1042 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.525056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 903 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.209845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  27.95 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  32.33 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.352979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 572 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  29.46 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1802  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.73 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 919 aa  57  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 459 aa  57  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2158  histidine kinase  24.86 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249399  normal  0.778679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 917 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 639 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  38.18 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 594 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0253  histidine kinase  24.67 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 919 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  26.58 
 
 		 982 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 528 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 732 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  30.74 
 
 		 927 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 729 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 991 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  29.19 
 
 		 549 aa  54.7  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.69 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.69 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1071  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 498 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1195 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 528 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  27.98 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 562 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121796  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 603 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 525 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  26.7 
 
 		 541 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.36 
 
 		 1162 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 991 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000969954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.72 
 
 		 1126 aa  53.5  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 546 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 757 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 793 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 642 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 991 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1000  histidine kinase  32.26 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  37.14 
 
 		 268 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2180  histidine kinase  28.15 
 
 		 530 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 439 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1195  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 609 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>