More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0968 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 544 aa  1079    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  53.22 
 
 		 544 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  50.64 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  48.81 
 
 		 548 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  48.15 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  37.69 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  36.47 
 
 		 551 aa  292  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 		 564 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 		 567 aa  238  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.55 
 
 		 569 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  33.88 
 
 		 457 aa  213  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  28.75 
 
 		 567 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  29.24 
 
 		 549 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 		 614 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  37.7 
 
 		 293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  28.68 
 
 		 576 aa  163  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  23.99 
 
 		 568 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  31.17 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  32.57 
 
 		 225 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.05 
 
 		 332 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.3 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 		 350 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 332 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 336 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.89 
 
 		 335 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 332 aa  98.6  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.85 
 
 		 341 aa  97.8  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.08 
 
 		 346 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 		 347 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.08 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 330 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.49 
 
 		 366 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 350 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.26 
 
 		 330 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.9 
 
 		 330 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.89 
 
 		 371 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  27.47 
 
 		 334 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  27.9 
 
 		 334 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.9 
 
 		 330 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.15 
 
 		 346 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  27.68 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 325 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.43 
 
 		 330 aa  87  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.93 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.33 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.67 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.93 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.78 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25.93 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 		 346 aa  86.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  25.47 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 		 673 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.33 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.12 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.1 
 
 		 636 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  29.02 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  32.09 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 		 664 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  26.13 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  23.94 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.56 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.19 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.6 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.11 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  26.18 
 
 		 256 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.66 
 
 		 346 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  28.25 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  28.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  28.73 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  38.17 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.05 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 662 aa  74.3  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>