More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0143 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  71.88 
 
 
65 aa  94.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  75 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 
64 aa  77  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  51.52 
 
 
867 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  48.48 
 
 
925 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  44.44 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
835 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  46.77 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
859 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  44.44 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  42.37 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  37.88 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  40.91 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
833 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  44.07 
 
 
913 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
852 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  41.54 
 
 
907 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
839 aa  54.3  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  41.27 
 
 
810 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  44.07 
 
 
907 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
64 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  42.37 
 
 
955 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  42.37 
 
 
961 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  42.37 
 
 
955 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  37.5 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  37.5 
 
 
71 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
228 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  37.31 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
66 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0962  copper exporting ATPase  40.62 
 
 
832 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.220688  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  40.32 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
740 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
939 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01270  putative metal-binding protein  49.25 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
850 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  44.07 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
750 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
855 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 
741 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
789 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  45.45 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  38.1 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
740 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
835 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  38.98 
 
 
742 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
767 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  47.06 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0562  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.304776  normal  0.828863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  42.19 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
762 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  42.19 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  42.19 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0545  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  47.06 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  42.19 
 
 
833 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
778 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0552  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
762 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
762 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0606  copper exporting ATPase  45.45 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  34.85 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40 
 
 
954 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  42.62 
 
 
562 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
793 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1061 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  34.85 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>