207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1366 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  100 
 
 		 274 aa  540  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  59.62 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  63.31 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  54.66 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  58 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  60.36 
 
 		 259 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  54.1 
 
 		 246 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  59.91 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1516  heme exporter protein CcmC  53.53 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  52.67 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  55.74 
 
 		 245 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  56.07 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  57.94 
 
 		 243 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4002  heme exporter protein CcmC  56.6 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  52.72 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  48.76 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  50.43 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  57.56 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  50.43 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.08 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  49.17 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.5 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  56.9 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.56 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  47.11 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  49.36 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3633  heme exporter protein CcmC  50.42 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3254  heme exporter protein CcmC  48.25 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  47.93 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  47.93 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  47.52 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  47.58 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0587  heme exporter protein CcmC  55.36 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  47.5 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  47.46 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3022  heme exporter protein CcmC  46.53 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  46.41 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  48.47 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0229  heme exporter protein CcmC  48.95 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162177  unclonable  0.000000000040148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  49.53 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0261  heme exporter protein CcmC  48.12 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  48.52 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  50.47 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  48.67 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0229  heme exporter protein CcmC  48.12 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0706055  unclonable  0.0000000000357328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0224  heme exporter protein CcmC  48.12 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3729  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0988482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  49.54 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  53.88 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3571  heme exporter protein CcmC  47.7 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  50.47 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  47.26 
 
 		 265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 		 248 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 		 248 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 		 248 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  48.54 
 
 		 248 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0243  heme exporter protein CcmC  49.37 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  hitchhiker  0.000734181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  47.6 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  49.78 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  46.99 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  48.03 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  45.71 
 
 		 245 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  46.81 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  46.94 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0393  heme exporter protein CcmC  46.81 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.341263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1498  heme exporter protein CcmC  46.81 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.743155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0920  heme exporter protein CcmC  44.27 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2111  heme exporter protein CcmC  46.35 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  45.52 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0889  heme exporter protein CcmC  43.87 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06064  ABC transporter heme permease  49.6 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0747582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00863  ABC transporter heme permease  49.6 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  46.52 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1827  heme exporter, subunit CcmC  45.92 
 
 		 262 aa  205  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1032  heme exporter protein CcmC  47.03 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.756263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00215  heme exporter protein C; cytochrome C-type biogenesis protein  51.44 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  45.73 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  45.15 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0188  heme exporter protein CcmC  50.42 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000216474  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  46.09 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4661  heme exporter protein CcmC  50.42 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.727875  hitchhiker  0.000000192901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  47.53 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  44.87 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  44.78 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  45.69 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  44.4 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  47.83 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4100  ABC superfamily  48.05 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2436  ABC superfamily  48.05 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236791  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  50.97 
 
 		 254 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  49.51 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0177  heme exporter protein CcmC  47.68 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>