More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3341 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 325 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  45.67 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  44.83 
 
 		 284 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  41.82 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  27.1 
 
 		 731 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  26.64 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 908 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  22.8 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  95.45 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 902 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 910 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 915 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 897 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 907 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 907 aa  57  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 908 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 901 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 936 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 934 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 924 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  100 
 
 		 923 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 934 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 936 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 1118 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 936 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 930 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 934 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 962 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  80.77 
 
 		 962 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 962 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 944 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 917 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 897 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 916 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  83.33 
 
 		 909 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 909 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0745  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 919 aa  55.8  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.864781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 907 aa  56.2  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 911 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 907 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 917 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 917 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 909 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  58.14 
 
 		 585 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 842 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 903 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 899 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 900 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 930 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 907 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 906 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_002950  PG0514  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 1113 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00876385 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 914 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  90 
 
 		 893 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1029  hypothetical protein  26.64 
 
 		 410 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 904 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 901 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 912 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 906 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 914 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  95 
 
 		 909 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  85.71 
 
 		 922 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 921 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  86.96 
 
 		 949 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 896 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 910 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  90 
 
 		 931 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>