89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2265 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2265  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
380 aa  779    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  40.38 
 
 
364 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4536  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.15899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 
362 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
362 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
362 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
366 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 
362 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
366 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
366 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
366 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  28.57 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
366 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 
362 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
366 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 
369 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  29.03 
 
 
366 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.98 
 
 
362 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.44 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3949  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.43441  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  27.67 
 
 
365 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1375  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
362 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0267839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1258  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.87 
 
 
354 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  27.87 
 
 
362 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3214  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2867  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3438  hypothetical protein  26.73 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6139  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.160536  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  25.44 
 
 
403 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0161  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
368 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3586  hypothetical protein  24.4 
 
 
371 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2764  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.247835  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6109  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.42 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3211  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  25.4 
 
 
381 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1449  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2864  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 
380 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2402  hypothetical protein  21.82 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.859613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02405  periplasmic iron-binding protein  24.04 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1804  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  25.31 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4258  putative iron ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  22.76 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289237  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0059  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3637  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.276394  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4161  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  22.46 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648243  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3338  putative iron ABC transporter, substrate-binding protein  23.32 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4430  periplasmic iron-binding protein  23.84 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3357  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.825817  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0729  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
363 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.706674  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0288  periplasmic iron-binding protein  22.62 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0059  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0259  extracellular solute-binding protein  21.79 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0309  periplasmic iron-binding protein  22.77 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3493  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.685703  normal  0.0583739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3126  putative periplasmic iron-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2735  putative iron(III) transport system substrate-binding protein  25.84 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0641317  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  24.55 
 
 
359 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1875  hypothetical protein  25.33 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21960  hypothetical protein  24.93 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000202681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1726  ABC transporter, periplasmic binding protein  23.33 
 
 
354 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477367  normal  0.0250834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4733  putative periplasmic solute-binding protein  27.92 
 
 
155 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  23.29 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3993  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  23.03 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.249752  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2471  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1233  hypothetical protein  27.11 
 
 
393 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1275  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  0.567692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  21.94 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1027  hypothetical protein  25.07 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1318  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
352 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.801159  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
362 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0354  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
356 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
362 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
362 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
356 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
362 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.14 
 
 
356 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0829  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
368 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000661  putative periplasmic solute-binding protein  24.45 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1111  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  24.15 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4785  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 
363 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5374  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.5 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0583866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.5 
 
 
362 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4569  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
326 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1471  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
340 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>