285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1883 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  66.36 
 
 
567 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2406  histidine ammonia-lyase  81.13 
 
 
552 aa  926    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1883  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
552 aa  1132    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  50 
 
 
567 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  37.99 
 
 
540 aa  286  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  35.71 
 
 
715 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06075  phenylalanine ammonia-lyase (AFU_orthologue; AFUA_2G09110)  35.48 
 
 
701 aa  269  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0383737  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  35.68 
 
 
516 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  36.72 
 
 
498 aa  266  7e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  35.88 
 
 
507 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 
511 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03897  conserved hypothetical protein  34.85 
 
 
686 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000679647  normal  0.349897 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  33.62 
 
 
517 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  33.76 
 
 
509 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 
531 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  34.01 
 
 
508 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  35.04 
 
 
521 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  34.83 
 
 
521 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  34.83 
 
 
521 aa  246  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  34.62 
 
 
521 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  35.92 
 
 
528 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  32.5 
 
 
518 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  34.06 
 
 
516 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 
520 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  33.86 
 
 
508 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  32.43 
 
 
506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 
524 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  33.94 
 
 
524 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  34.97 
 
 
515 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  33.74 
 
 
524 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  33.94 
 
 
524 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  32.64 
 
 
531 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  32.95 
 
 
531 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  35.99 
 
 
505 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  33.82 
 
 
502 aa  242  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 
519 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  34.49 
 
 
528 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  34.92 
 
 
514 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  34.62 
 
 
513 aa  242  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 
524 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  33.47 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  34.31 
 
 
504 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  33.7 
 
 
507 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  33.76 
 
 
532 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  33.76 
 
 
532 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 
520 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  32.55 
 
 
535 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  34.49 
 
 
540 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
489 aa  237  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  33.84 
 
 
540 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03915  histidine ammonia-lyase  30.73 
 
 
511 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.699156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  32.51 
 
 
509 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  32.22 
 
 
506 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  32.75 
 
 
520 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  30.45 
 
 
505 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  33.09 
 
 
520 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  29.98 
 
 
512 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  33.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 
507 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  30.53 
 
 
505 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  30.45 
 
 
505 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  33.6 
 
 
507 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  32.94 
 
 
533 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
506 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1335  histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 
506 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 
507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02290  histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 
537 aa  221  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1331  histidine ammonia-lyase  32.72 
 
 
506 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  32.32 
 
 
536 aa  219  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  30.26 
 
 
505 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.78 
 
 
511 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  32.92 
 
 
523 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  32.46 
 
 
514 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  33.2 
 
 
507 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  33 
 
 
506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  31.4 
 
 
526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  32 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  32 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  29.89 
 
 
505 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 
511 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2172  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  32.95 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6451  histidine ammonia-lyase  34.03 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  32.27 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  34.18 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  32.78 
 
 
511 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  33.76 
 
 
514 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  33.62 
 
 
511 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1106  histidine ammonia-lyase  34.04 
 
 
512 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  32.46 
 
 
511 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  32.62 
 
 
513 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1837  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 
526 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0180395 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0996  histidine ammonia-lyase  34.33 
 
 
512 aa  211  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.168418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>