206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1781 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  446  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1542  hypothetical protein  32.87 
 
 
235 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391091  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.36 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  26.94 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  29.17 
 
 
592 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.19 
 
 
613 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  27.2 
 
 
593 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  29.81 
 
 
589 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  28.98 
 
 
245 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  34.09 
 
 
735 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.57 
 
 
587 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  22.75 
 
 
741 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  22.75 
 
 
741 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  26.7 
 
 
616 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 
641 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 
604 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  26.91 
 
 
618 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 
594 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  23.33 
 
 
754 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  24.7 
 
 
694 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.75 
 
 
614 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 
703 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.62 
 
 
712 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  25.36 
 
 
741 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  26.92 
 
 
1003 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  23.81 
 
 
595 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  29.31 
 
 
611 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  29.69 
 
 
748 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  27.32 
 
 
687 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 
769 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  25.12 
 
 
320 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  23.15 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  26.55 
 
 
618 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  35.23 
 
 
753 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 
734 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 
618 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 
734 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
731 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.53 
 
 
598 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  23.9 
 
 
578 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  25.85 
 
 
729 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1195  ribosomal protein L7/L12  31.73 
 
 
860 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191109  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
734 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  27.59 
 
 
704 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  46.81 
 
 
713 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.82 
 
 
794 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 
757 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 
731 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 
545 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 
545 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  21.39 
 
 
602 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  25.64 
 
 
729 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 
596 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  25.64 
 
 
730 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 
661 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  25 
 
 
680 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 
606 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.73 
 
 
661 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 
596 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  29.14 
 
 
709 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
633 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
633 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  23.38 
 
 
645 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  31.52 
 
 
697 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  32.97 
 
 
771 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  27.44 
 
 
680 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  19.85 
 
 
754 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  24.52 
 
 
565 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
633 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 
725 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  23.32 
 
 
683 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 
655 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 
699 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0476  VgrG protein  23.08 
 
 
531 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.245187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
713 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
702 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  27.68 
 
 
727 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 
697 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 
706 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.99 
 
 
741 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
633 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
713 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
702 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
713 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  27.16 
 
 
196 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  46.51 
 
 
702 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  31.18 
 
 
694 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  32.99 
 
 
741 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>