57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1096 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1096  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1128    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  53.05 
 
 
914 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  42.35 
 
 
795 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04221  nuclease  48.42 
 
 
297 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512426  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.5 
 
 
810 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  38.89 
 
 
802 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.68 
 
 
929 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 
802 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1553  hypothetical protein  40.39 
 
 
277 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.82 
 
 
940 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  42.22 
 
 
1577 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  41.81 
 
 
1577 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  39.55 
 
 
1652 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  41.08 
 
 
1591 aa  95.1  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5269  hypothetical protein  38.78 
 
 
305 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.98 
 
 
830 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  39.78 
 
 
1512 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.33 
 
 
1394 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5152  hypothetical protein  32.54 
 
 
382 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.698253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.92 
 
 
821 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.46 
 
 
1525 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  55.56 
 
 
453 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.79 
 
 
2313 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  33.15 
 
 
902 aa  71.2  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
1052 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  51.88 
 
 
1159 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  41.71 
 
 
625 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.41 
 
 
1307 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  40.24 
 
 
605 aa  57.4  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  24.57 
 
 
1000 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  39.72 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  57.78 
 
 
793 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  23.89 
 
 
1847 aa  53.9  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  54.76 
 
 
356 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  39.45 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.96 
 
 
846 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  48.33 
 
 
682 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  40 
 
 
2353 aa  50.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0111  hypothetical protein  27.43 
 
 
1165 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  38.07 
 
 
916 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  55.68 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  45.45 
 
 
433 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  47.06 
 
 
259 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  38.26 
 
 
582 aa  47.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  40.54 
 
 
671 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  40.31 
 
 
904 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  37.61 
 
 
467 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  54.43 
 
 
455 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2233  extracellular solute-binding protein family 5  45.87 
 
 
735 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.039331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  47.27 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 
257 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  42.57 
 
 
551 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  44.74 
 
 
639 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  46.48 
 
 
653 aa  44.3  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  36.81 
 
 
1096 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3859  hypothetical protein  49.52 
 
 
182 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.22 
 
 
1401 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>