19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1553 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04221  nuclease  45.6 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  47.95 
 
 		 1652 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.15 
 
 		 940 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  41.86 
 
 		 795 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 		 929 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.35 
 
 		 810 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.38 
 
 		 802 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1096  hypothetical protein  40.2 
 
 		 581 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  36.56 
 
 		 802 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  38.86 
 
 		 1591 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  43.14 
 
 		 1577 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  36.46 
 
 		 902 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  50 
 
 		 1577 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  35.79 
 
 		 1512 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.45 
 
 		 821 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 1525 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 1052 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0163  hypothetical protein  38.04 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>