286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1329 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
342 aa  703    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  61.4 
 
 
341 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  41.3 
 
 
338 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  36.2 
 
 
590 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  34.58 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 
339 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  32.86 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  35.65 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  34.71 
 
 
340 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  35.07 
 
 
339 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  34.31 
 
 
339 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  34.31 
 
 
339 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  33.9 
 
 
342 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  34 
 
 
342 aa  202  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.43 
 
 
334 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  32.04 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  34.94 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  32.75 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.17 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  32.46 
 
 
338 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.17 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  32.17 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  32.17 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  32.17 
 
 
338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.92 
 
 
341 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 
338 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  31.88 
 
 
338 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  31.88 
 
 
338 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  33.33 
 
 
331 aa  192  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  30.81 
 
 
337 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  32.38 
 
 
339 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  30.81 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  33.33 
 
 
334 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 
348 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  30.79 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  33.53 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.32 
 
 
340 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  28.4 
 
 
340 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  30.5 
 
 
344 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.95 
 
 
335 aa  166  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.42 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
329 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 
336 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  33.33 
 
 
332 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  29.59 
 
 
351 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  31.98 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 
343 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  28.41 
 
 
359 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  28.18 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  31.11 
 
 
342 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  28.83 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  27.42 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  30.86 
 
 
318 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.65 
 
 
317 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  26.32 
 
 
367 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  29.24 
 
 
317 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  26.04 
 
 
366 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.81 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  25.91 
 
 
366 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.86 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.08 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  28.65 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  23.88 
 
 
368 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  28.45 
 
 
321 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  26.89 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 
329 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  26.69 
 
 
317 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  30.28 
 
 
344 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 
301 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.57 
 
 
320 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
320 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  27.72 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.3 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  26.11 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  30.95 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  28.3 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.18 
 
 
327 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  27.1 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.97 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  26.13 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  26.69 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  27.5 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  23.81 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  27.19 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  30.17 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.63 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  31.79 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.39 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.54 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  25.96 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  27.39 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25.07 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>