71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0628 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  68.87 
 
 
212 aa  294  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  67.45 
 
 
212 aa  287  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  66.04 
 
 
212 aa  278  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  65.57 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  65.57 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  65.57 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  51.16 
 
 
213 aa  208  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  50.23 
 
 
212 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  50.23 
 
 
233 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  49.77 
 
 
222 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  47.22 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  50.23 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  50.93 
 
 
211 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  45.28 
 
 
219 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  41.58 
 
 
346 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  39.47 
 
 
346 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  39.47 
 
 
346 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  39.47 
 
 
346 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  40.44 
 
 
352 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  38.42 
 
 
350 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  41.67 
 
 
343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.65 
 
 
224 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  31.67 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  31.94 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  30.11 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 
228 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
1204 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  34.39 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.39 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.39 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  34.39 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  30.05 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  33.76 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  25.76 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  37.29 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  32.2 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  34.68 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  31.94 
 
 
268 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  30.34 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  27.98 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2394  von Willebrand factor, type A  36.29 
 
 
972 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.400523  hitchhiker  0.00000432302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  31.71 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  28.02 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  34.45 
 
 
412 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  33.61 
 
 
412 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  29.83 
 
 
546 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
547 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  24.34 
 
 
744 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 
421 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.13 
 
 
776 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  33.61 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
418 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
383 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 
573 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
543 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>