More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0590 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0590  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2633  ABC transporter-related protein  54.41 
 
 		 270 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1780  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  55.17 
 
 		 271 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1888  ABC transporter related  55.17 
 
 		 271 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.26331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2544  peptide transport system ATP-binding protein  55.17 
 
 		 271 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1820  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.90889e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1636  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.55489  hitchhiker  0.00000000158294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1825  peptide transport system ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186073  hitchhiker  0.003112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1454  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1882  peptide ABC transporter ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  304  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36018  hitchhiker  0.000716142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2346  ABC transporter related  53.46 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  54.02 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733076 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01267  predicted antimicrobial peptide transporter subunit  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2356  ABC transporter related protein  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01278  hypothetical protein  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1497  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1404  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1832  peptide transport system, ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865298  hitchhiker  0.0000646533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2335  ABC transporter related  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1526  peptide ABC transporter, ATP-binding protein SapF  53.64 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.629898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2617  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 271 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0151151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1714  ABC transporter related  53.26 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2175  ABC transporter related  52.87 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0158301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1748  ABC transporter related  52.49 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01866  hypothetical protein  48.61 
 
 		 260 aa  265  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003820  peptide transport system ATP-binding protein SapF  48.21 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0778601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0475  peptide transport system ATP-binding protein SapF  50.44 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1289  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2486  ABC transporter related  45.49 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2584  ABC transporter related  45.53 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1231  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3106  ABC transporter related  44.8 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231583  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2502  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1496  ABC transporter related  46.37 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1801  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2743  ABC transporter related  45.56 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.39241  normal  0.48715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1634  ABC transporter related  45.56 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1600  ABC transporter related  45.56 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00484848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1611  ABC transporter related  45.56 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1548  ABC transporter related  44.8 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.73885  hitchhiker  0.000980474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2488  ABC transporter related  45.6 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2654  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.53593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2556  ABC transporter related  45.2 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595528  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2675  ABC transporter related  45.16 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3779  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0394  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 339 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0442  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3086  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2952  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0247  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0260  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.24 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 345 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6388  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 338 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0224  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 338 aa  208  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3010  ABC transporter related  43.69 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0486798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2427  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3041  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2196  ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3305  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 335 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2973  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2117  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3374  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 338 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  38.96 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  39.76 
 
 		 549 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  40.16 
 
 		 328 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0398  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 		 348 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 334 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5040  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0624663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  38.43 
 
 		 546 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  38.55 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 423 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 328 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>