251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0901 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 345 aa  700    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  59.51 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.77 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.61 
 
 		 340 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  41.03 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  44.29 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.69 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  40.57 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.25 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  42.03 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  43.97 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.47 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.09 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  43.43 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  42.2 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.35 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.31 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  42.78 
 
 		 343 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.82 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.29 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.27 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  41.21 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.42 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  44.31 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  41.09 
 
 		 340 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.82 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  40.8 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.62 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  42.44 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.69 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  42.29 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  42.29 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  42.29 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  41.6 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  41.88 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.41 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.43 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.44 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.77 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.92 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.79 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.14 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.92 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.61 
 
 		 339 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.13 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.18 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.32 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.43 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.66 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  32.08 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.39 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.92 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.77 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.97 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.11 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.09 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.86 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.23 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.91 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.77 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.83 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.46 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.46 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  31.07 
 
 		 336 aa  149  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  30.84 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  26.96 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.92 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.06 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  29.75 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.15 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  32.86 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  31.91 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  29.95 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.69 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  29.06 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.89 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>