66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3428 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  58.81 
 
 		 1038 aa  1167    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  41.44 
 
 		 1053 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  46.31 
 
 		 1046 aa  846    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  43.73 
 
 		 1017 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  47.19 
 
 		 1036 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  44.02 
 
 		 1018 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1017 aa  2071    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  45.24 
 
 		 1611 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  52.19 
 
 		 902 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  38.38 
 
 		 1009 aa  522  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  36.09 
 
 		 1457 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  51.85 
 
 		 1294 aa  348  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  33.6 
 
 		 957 aa  320  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  33.48 
 
 		 958 aa  310  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  33.48 
 
 		 958 aa  310  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  42.51 
 
 		 1110 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  42.51 
 
 		 1106 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  31.81 
 
 		 955 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  34.21 
 
 		 1143 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  34.25 
 
 		 1143 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  26.75 
 
 		 901 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  38.24 
 
 		 1281 aa  95.1  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 2222 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  27.39 
 
 		 1276 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  27.75 
 
 		 1127 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  22.89 
 
 		 1596 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  26.43 
 
 		 2026 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  27.73 
 
 		 2499 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  27.08 
 
 		 1672 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  25.88 
 
 		 1329 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  26.51 
 
 		 1453 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  25.66 
 
 		 1196 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  26.03 
 
 		 1329 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  27.66 
 
 		 1379 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  27.44 
 
 		 1454 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  27.01 
 
 		 688 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  25.35 
 
 		 1691 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  26 
 
 		 1525 aa  61.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  24.23 
 
 		 2803 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  23.61 
 
 		 2081 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  26.83 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  31.22 
 
 		 979 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  22.23 
 
 		 1521 aa  57.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 1916 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  28.31 
 
 		 869 aa  55.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  26.05 
 
 		 1330 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  22.95 
 
 		 1438 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  30.05 
 
 		 1848 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  29.92 
 
 		 553 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  33.06 
 
 		 1645 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  22.57 
 
 		 340 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  25.31 
 
 		 711 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  25.43 
 
 		 1496 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.31 
 
 		 328 aa  48.9  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25 
 
 		 939 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 656 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 333 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  27.17 
 
 		 426 aa  45.8  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  26.57 
 
 		 333 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  25.66 
 
 		 318 aa  45.8  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  28.94 
 
 		 457 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  24.88 
 
 		 650 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  25.51 
 
 		 442 aa  45.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  25.26 
 
 		 658 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  22.87 
 
 		 335 aa  44.3  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1857  fibronectin type III domain-containing protein  23.03 
 
 		 733 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>