72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2155 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1767  Tetratricopeptide TPR_4  49.66 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0728  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00492584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2450  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.98 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0702  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.452088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0931  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.411142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1057  hypothetical protein  48.51 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0576  hypothetical protein  43.54 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0701  hypothetical protein  44.53 
 
 		 147 aa  123  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1585  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.97 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2945  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103456  hitchhiker  0.00885992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0607  TPR repeat-containing protein  41.48 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0621  TPR repeat-containing protein  41.48 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.20092e-35 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1411  Dihydrofolate reductase  35.71 
 
 		 306 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000149982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2799  dihydrofolate reductase region  34.97 
 
 		 306 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1481  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0771879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2386  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1573  Tetratricopeptide domain protein  28.99 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.845234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671338  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  37.08 
 
 		 725 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 565 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 219 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.58 
 
 		 733 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 523 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  29.81 
 
 		 338 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 416 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 689 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 582 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.46 
 
 		 967 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 370 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  32.65 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 581 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1338  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  35.19 
 
 		 545 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 597 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1092 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  35.19 
 
 		 587 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 654 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 622 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0726  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 870 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1421 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 878 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 		 1022 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  31.62 
 
 		 1089 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 364 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 		 252 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 3145 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 		 924 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 409 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.82 
 
 		 2145 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 310 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 341 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30 
 
 		 706 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 552 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  31.52 
 
 		 545 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.41 
 
 		 245 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 		 699 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 468 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1006  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 441 aa  40  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.37 
 
 		 810 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.26 
 
 		 887 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 1091 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 729 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>