More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1003 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  937    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  69.77 
 
 		 727 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  52.95 
 
 		 492 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  54.19 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  54 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  55.02 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  52.28 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  52.51 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  50.22 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  52.28 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  51.23 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  49.25 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  49.21 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  44.2 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  44.36 
 
 		 588 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  43.66 
 
 		 519 aa  353  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  51.26 
 
 		 543 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.53 
 
 		 506 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 472 aa  279  7e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 		 436 aa  275  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  35.03 
 
 		 495 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 		 496 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 441 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  33.05 
 
 		 495 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  32.58 
 
 		 561 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 609 aa  243  7e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 573 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 578 aa  239  9e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  33.96 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  33.4 
 
 		 573 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  33.13 
 
 		 569 aa  232  8.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 530 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 523 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.04 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  32.11 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.47 
 
 		 776 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 513 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 581 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  32.24 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 582 aa  195  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  30.6 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 559 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  28.93 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.04 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.31 
 
 		 706 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 514 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 514 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 514 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.68 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.68 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.68 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.68 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.98 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.57 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2293  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.1 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.62 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2335  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.1 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.75 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.05 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.81 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.69 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.98 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.05 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.59 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  31.52 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.34 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.72 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.96 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.07 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.34 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.81 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.76 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.47 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.46 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.98 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0376  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.24 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>