More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4495 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  79.41 
 
 		 189 aa  288  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  80.59 
 
 		 198 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  79.31 
 
 		 190 aa  284  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  79.41 
 
 		 194 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  79.41 
 
 		 191 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  77.78 
 
 		 191 aa  280  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  77.78 
 
 		 188 aa  279  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  78.95 
 
 		 192 aa  278  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 193 aa  278  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  76.74 
 
 		 189 aa  277  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  76.02 
 
 		 196 aa  277  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 199 aa  275  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75.29 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  74.42 
 
 		 190 aa  271  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  75.29 
 
 		 193 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  74.71 
 
 		 192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  73.84 
 
 		 187 aa  268  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  75.29 
 
 		 191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  73.84 
 
 		 189 aa  267  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  74.27 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  77.65 
 
 		 192 aa  262  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  78.82 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  78.36 
 
 		 189 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  79.41 
 
 		 187 aa  260  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  77.91 
 
 		 187 aa  260  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  78.24 
 
 		 187 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  78.24 
 
 		 187 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  78.24 
 
 		 187 aa  259  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  76 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 188 aa  255  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  67.25 
 
 		 190 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  67.65 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  78.36 
 
 		 199 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  64.33 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  69.41 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  66.47 
 
 		 186 aa  241  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  73.53 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.63 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  63.74 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  63.74 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  64.12 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  64.12 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  64.12 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  64.12 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.4 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  61.4 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  61.4 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.33 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.82 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  62.94 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  62.35 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  61.18 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.79 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  62.35 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.47 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.94 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  62.35 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  62.35 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  62.35 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  60.59 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  61.18 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.76 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.82 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.48 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  61.18 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  59.06 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  62.57 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  59.06 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  62.94 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.48 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  59.65 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.76 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  57.65 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.48 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  59.2 
 
 		 192 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>