More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1559 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  100 
 
 		 192 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  55.23 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  54.91 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  53.76 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  62.16 
 
 		 251 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  52.67 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  45.88 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  44.37 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  51.3 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  46.1 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  50 
 
 		 247 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  48.78 
 
 		 241 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.28 
 
 		 274 aa  111  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  52.94 
 
 		 285 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45 
 
 		 582 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.22 
 
 		 411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  52.63 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  47.32 
 
 		 529 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.83 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.63 
 
 		 430 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  45.9 
 
 		 363 aa  106  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  56.67 
 
 		 419 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  46.61 
 
 		 300 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.86 
 
 		 304 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  50.45 
 
 		 523 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.38 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.33 
 
 		 375 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  45 
 
 		 610 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.86 
 
 		 324 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  45.69 
 
 		 271 aa  104  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  47.58 
 
 		 388 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  50.86 
 
 		 323 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.49 
 
 		 824 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.76 
 
 		 400 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  45.65 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  42.11 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.09 
 
 		 590 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  45.54 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  44.07 
 
 		 404 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  41.82 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  45.45 
 
 		 334 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.22 
 
 		 303 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  46.02 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.79 
 
 		 321 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0592  M23/M37 familypeptidase  45.27 
 
 		 282 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  46.02 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  52.25 
 
 		 252 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  40 
 
 		 417 aa  99.8  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  41.73 
 
 		 305 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  47.37 
 
 		 347 aa  99.8  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.74 
 
 		 377 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  44.09 
 
 		 265 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  41.73 
 
 		 305 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  46.61 
 
 		 751 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  46.85 
 
 		 687 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  46.43 
 
 		 248 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.11 
 
 		 351 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.94 
 
 		 305 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.25 
 
 		 309 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  40.94 
 
 		 605 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.95 
 
 		 314 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  44.25 
 
 		 274 aa  98.6  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.28 
 
 		 367 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.61 
 
 		 313 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  44.04 
 
 		 271 aa  98.2  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  46.34 
 
 		 284 aa  98.2  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  41.67 
 
 		 452 aa  98.2  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.15 
 
 		 430 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  44.04 
 
 		 271 aa  97.8  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  47.83 
 
 		 394 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  48.15 
 
 		 415 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  49.56 
 
 		 299 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  50.44 
 
 		 299 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  44.25 
 
 		 333 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  45 
 
 		 390 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.45 
 
 		 348 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  43.1 
 
 		 316 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  45.97 
 
 		 475 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  41.03 
 
 		 283 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  47.46 
 
 		 323 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.7 
 
 		 423 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.54 
 
 		 442 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  43.2 
 
 		 321 aa  95.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  44.04 
 
 		 296 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.08 
 
 		 328 aa  95.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  43.36 
 
 		 298 aa  95.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.83 
 
 		 727 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.83 
 
 		 727 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.07 
 
 		 249 aa  94.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  50.86 
 
 		 299 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  47.41 
 
 		 229 aa  94.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  45.05 
 
 		 469 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  45.05 
 
 		 469 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  42.98 
 
 		 414 aa  94.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.34 
 
 		 247 aa  94.4  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  46.79 
 
 		 458 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  44.25 
 
 		 305 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  48.67 
 
 		 299 aa  94  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  45.9 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  42.73 
 
 		 308 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>