61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1650 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  52.31 
 
 
342 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  56.19 
 
 
336 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  50.31 
 
 
340 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  48.15 
 
 
340 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  48.62 
 
 
336 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  50.16 
 
 
329 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  31.46 
 
 
350 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  31.76 
 
 
328 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  27.22 
 
 
360 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  31.55 
 
 
346 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  26.76 
 
 
334 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1984  hypothetical protein  26.4 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0203809  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  28.08 
 
 
378 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  25.61 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1857  hypothetical protein  28.2 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2088  hypothetical protein  28.16 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.491355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2003  hypothetical protein  27.8 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0754159  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  28.06 
 
 
574 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  21.71 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.23 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  28.95 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.47 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.82 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  27.1 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  24.67 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
613 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.26 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  30.08 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  23.03 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.66 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  32 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  25.33 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  26.86 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  25.24 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
606 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  19.28 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  22.08 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  28.48 
 
 
346 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  26.33 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.54 
 
 
775 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  22.5 
 
 
351 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.57 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  22.04 
 
 
334 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  24.35 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.29 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  32.73 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  32.67 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.19 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  28.45 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  31.82 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  29.26 
 
 
326 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  21.73 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  34.91 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  30.63 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  23.73 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.77 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  20.35 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1552  hypothetical protein  25.78 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>