21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3213 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  90.57 
 
 		 331 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  47.68 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  34.02 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.8 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  29.52 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  29.52 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.17 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  23.64 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  34.19 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.94 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  27.17 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  32.04 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  21.2 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 606 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  29.83 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  20.42 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  27.55 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.36 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  29.73 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  27.54 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>