15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4038 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  26.3 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  23.84 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  23.31 
 
 
350 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  32 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  28.95 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  21.81 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  22.32 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  39.76 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  26.07 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  28.28 
 
 
339 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  21.68 
 
 
336 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  24.92 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  24.56 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>