137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3369 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3369  N-formylglutamate amidohydrolase  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1751  N-formylglutamate amidohydrolase  54.32 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3744  hypothetical protein  49.64 
 
 
298 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5950  N-formylglutamate amidohydrolase  49.64 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  49.45 
 
 
310 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  50.91 
 
 
296 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3623  N-formylglutamate amidohydrolase  47.58 
 
 
293 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259155  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2718  N-formylglutamate amidohydrolase  47.43 
 
 
293 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.081186  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4283  N-formylglutamate amidohydrolase  46.79 
 
 
296 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0042  N-formylglutamate amidohydrolase  47.43 
 
 
300 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3324  N-formylglutamate amidohydrolase  47.21 
 
 
293 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.604083 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0042  putative formiminoglutamase  46.43 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3275  N-formylglutamate amidohydrolase  47.54 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0044  formiminoglutamase, putative  46.43 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3643  N-formylglutamate amidohydrolase  49.81 
 
 
321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00118942  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3599  N-formylglutamate amidohydrolase  47.54 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1997  N-formylglutamate amidohydrolase  45.55 
 
 
340 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3473  N-formylglutamate amidohydrolase  47.5 
 
 
298 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2817  N-formylglutamate amidohydrolase  48.69 
 
 
295 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224452  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1235  N-formylglutamate amidohydrolase  45.39 
 
 
312 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0636119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2749  N-formylglutamate amidohydrolase  45.94 
 
 
296 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00022446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4357  N-formylglutamate amidohydrolase  45.05 
 
 
295 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00044284  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0780  N-formylglutamate amidohydrolase  42.51 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4516  N-formylglutamate amidohydrolase  44.37 
 
 
295 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2506  N-formylglutamate amidohydrolase  45.35 
 
 
314 aa  229  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1390  putative N-formylglutamate amidohydrolase  44.53 
 
 
294 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0000503098  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  43.66 
 
 
286 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2947  N-formylglutamate amidohydrolase  42.61 
 
 
295 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 
286 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0975  N-formylglutamate amidohydrolase  42.49 
 
 
295 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181789  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1142  N-formylglutamate amidohydrolase  42.65 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  44.07 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  43.26 
 
 
285 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0862  N-formylglutamate amidohydrolase  45 
 
 
319 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  42.34 
 
 
287 aa  208  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2807  N-formylglutamate amidohydrolase  43.46 
 
 
286 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1017  N-formylglutamate amidohydrolase  42.03 
 
 
296 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0981  N-formylglutamate amidohydrolase  40.94 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379213  normal  0.0846984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4633  N-formylglutamate amidohydrolase  41.9 
 
 
295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0056  N-formylglutamate amidohydrolase  44.62 
 
 
287 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4135  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2540  N-formylglutamate amidohydrolase  41.35 
 
 
281 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3507  N-formylglutamate amidohydrolase  40.14 
 
 
292 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3358  N-formylglutamate amidohydrolase  40.51 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3345  N-formylglutamate amidohydrolase  41.76 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115706  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1246  N-formylglutamate amidohydrolase  38.77 
 
 
284 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3995  N-formylglutamate amidohydrolase  41.76 
 
 
312 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.359925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2708  N-formylglutamate amidohydrolase  39.54 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0880  N-formylglutamate amidohydrolase  37.72 
 
 
310 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0785  N-formylglutamate amidohydrolase  40.65 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0856  N-formylglutamate amidohydrolase  41.18 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5206  N-formylglutamate amidohydrolase  40.07 
 
 
290 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0284  N-formylglutamate amidohydrolase  38.27 
 
 
299 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5471  N-formylglutamate amidohydrolase  40.29 
 
 
301 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1476  hypothetical protein  38.58 
 
 
302 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2131  hypothetical protein  38.58 
 
 
302 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230239  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0814  hypothetical protein  38.58 
 
 
302 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1827  N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0498  putative N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0400  putative N-formylglutamate amidohydrolase  38.58 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679074  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8166  hypothetical protein  33.7 
 
 
285 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0136  N-formylglutamate amidohydrolase  37.45 
 
 
286 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1288  N-formylglutamate amidohydrolase  37.13 
 
 
302 aa  138  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1334  N-formylglutamate amidohydrolase  38.21 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0893602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  38.49 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0931  formiminoglutamase  32.06 
 
 
266 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0873  N-formylglutamate amidohydrolase  31.71 
 
 
266 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4694  N-formylglutamate amidohydrolase  36.1 
 
 
270 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1434  N-formylglutamate amidohydrolase  32.26 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  34.4 
 
 
270 aa  115  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4353  N-formylglutamate deformylase  32.37 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4836  N-formylglutamate deformylase  34.31 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0344963  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0712  N-formylglutamate amidohydrolase  31.11 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1808  N-formylglutamate amidohydrolase  34.87 
 
 
270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5278  formimidoylglutamase, putative  33.05 
 
 
266 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2984  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 
266 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  35.86 
 
 
274 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3006  N-formylglutamate amidohydrolase  30.51 
 
 
258 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1690  N-formylglutamate amidohydrolase  34.04 
 
 
267 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1536  N-formylglutamate amidohydrolase  34.82 
 
 
271 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0166  N-formylglutamate amidohydrolase  35.12 
 
 
271 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0435  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 
267 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.146539  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5957  N-formylglutamate amidohydrolase  30.47 
 
 
268 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3650  N-formylglutamate amidohydrolase  34.52 
 
 
273 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0357384  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4903  N-formylglutamate amidohydrolase  33.05 
 
 
267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  33.2 
 
 
265 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1300  N-formylglutamate deformylase  34.82 
 
 
264 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5929  N-formylglutamate amidohydrolase  31.06 
 
 
267 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823902  normal  0.116063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4657  N-formylglutamate amidohydrolase  30.83 
 
 
271 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal  0.0289491 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  33.96 
 
 
267 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  36.17 
 
 
267 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0156  N-formylglutamate amidohydrolase  35.27 
 
 
287 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5029  N-formylglutamate amidohydrolase  31.8 
 
 
267 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6924  N-formylglutamate amidohydrolase  29.03 
 
 
273 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0775276  normal  0.855741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0368  N-formylglutamate deformylase  31.44 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2551  N-formylglutamate amidohydrolase  31.95 
 
 
284 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.941162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1166  N-formylglutamate amidohydrolase  33.47 
 
 
291 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2941  N-formylglutamate deformylase  34.84 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1748  N-formylglutamate amidohydrolase  30.99 
 
 
277 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00019143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5079  N-formylglutamate amidohydrolase  32.56 
 
 
267 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2360  N-formylglutamate amidohydrolase  34.57 
 
 
285 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>