293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2900 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.92 
 
 
298 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  60.61 
 
 
319 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.93 
 
 
319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.54 
 
 
301 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.78 
 
 
297 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.88 
 
 
303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.88 
 
 
303 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.2 
 
 
303 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.54 
 
 
307 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.36 
 
 
299 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.75 
 
 
310 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  36.95 
 
 
300 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  32.89 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  37.15 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02506  conserved hypothetical protein  30.42 
 
 
439 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0777894  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08988  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
295 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68551  hypothetical protein  27.66 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.45922  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  35.09 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
296 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
302 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  30.84 
 
 
297 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.46 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.46 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
297 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
286 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
297 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
298 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
312 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
293 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  28.99 
 
 
301 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
293 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
294 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
295 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  31.13 
 
 
316 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 
295 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
295 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
295 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.25 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
298 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01610  hypothetical protein  26.2 
 
 
364 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02225  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07170)  28.16 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.439161  normal  0.578499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
294 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
296 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
311 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
292 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.94 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.1 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09152  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.88 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.23 
 
 
332 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.74 
 
 
285 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.16 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  24 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  24 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  29.63 
 
 
619 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1568  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  25.23 
 
 
340 aa  56.6  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3787  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.16 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.11 
 
 
332 aa  56.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.37 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  39.13 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.71 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05409  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.172063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.11 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>