More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2179 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  69.44 
 
 		 190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  56.91 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  58.1 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  56.54 
 
 		 197 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  58.78 
 
 		 156 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  48.33 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  44.68 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  41.27 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  41.27 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  41.58 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  40.74 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  39.38 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  41.05 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  41.58 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  39.38 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  40.89 
 
 		 441 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  42.62 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  42.78 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.2 
 
 		 197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  41.53 
 
 		 420 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  41.99 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  39.79 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.8 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  41.34 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  39.78 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  46.86 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  39.15 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  39.46 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  39.23 
 
 		 421 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  39.15 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.1 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.68 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  38.66 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  39.44 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  39.62 
 
 		 416 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  38.38 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.79 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.33 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  36.41 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  36.56 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.23 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  42.31 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  41.57 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.17 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.71 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  34.81 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.07 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  44.21 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  40.98 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.71 
 
 		 184 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  38.98 
 
 		 174 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.36 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.98 
 
 		 175 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.98 
 
 		 175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  40.11 
 
 		 177 aa  97.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  33.51 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.5 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  40 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  40.11 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  40.11 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  39.66 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  33.69 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  38.42 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  40.11 
 
 		 177 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  38.46 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.34 
 
 		 173 aa  94.7  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  34.92 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  33.7 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  40.98 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.78 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.46 
 
 		 175 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0144  cytochrome B561  34.69 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.876682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.67 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.39 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  37.7 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.42 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  35.36 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  33.16 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.91 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.97 
 
 		 181 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  36.61 
 
 		 177 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  38.2 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  37.91 
 
 		 177 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.56 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  34.78 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  34.24 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  46.77 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.24 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  34.25 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  34.25 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  34.25 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.47 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  33.7 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  34.25 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  33.99 
 
 		 406 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.25 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  34.25 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  33.15 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>