48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1784 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 1164 aa  2402    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  38.57 
 
 		 1126 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  38.63 
 
 		 1126 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1100 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1049 aa  436  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  32.21 
 
 		 1056 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1220 aa  342  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  30.31 
 
 		 1094 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  37.01 
 
 		 549 aa  323  9.000000000000001e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1092 aa  316  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.46 
 
 		 1477 aa  290  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.34 
 
 		 605 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  40.46 
 
 		 1157 aa  256  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  33.46 
 
 		 1087 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  36.54 
 
 		 1061 aa  218  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  31.5 
 
 		 498 aa  204  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  26.03 
 
 		 1132 aa  102  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.39 
 
 		 958 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  25.16 
 
 		 1171 aa  77  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 1185 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 		 1196 aa  76.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1176 aa  76.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  44.09 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  26.24 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.28 
 
 		 1190 aa  73.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  25 
 
 		 1335 aa  70.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 		 975 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  20.06 
 
 		 1002 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.99 
 
 		 914 aa  58.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.08 
 
 		 925 aa  56.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  24.83 
 
 		 946 aa  55.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1062 aa  54.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  25.16 
 
 		 985 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.93 
 
 		 622 aa  53.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.32 
 
 		 622 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.12 
 
 		 619 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.18 
 
 		 922 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.45 
 
 		 916 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  23.84 
 
 		 758 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.29 
 
 		 932 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  22.19 
 
 		 636 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.16 
 
 		 754 aa  49.3  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.04 
 
 		 1099 aa  47.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  23.16 
 
 		 903 aa  47  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.14 
 
 		 914 aa  46.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1722 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>