More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1661 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1661  transposase IS110 family protein  100 
 
 
379 aa  758    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3226  transposase IS110 family protein  100 
 
 
379 aa  758    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.731441  normal  0.669457 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.83 
 
 
383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273009  normal  0.772032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.14 
 
 
384 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756749  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3060  transposase IS116/IS110/IS902  46.91 
 
 
383 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137931  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4315  transposase IS116/IS110/IS902  47.7 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.56 
 
 
366 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.59 
 
 
539 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3995  transposase IS116/IS110/IS902  46.22 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.57 
 
 
326 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1954  transposase IS116/IS110/IS902  43.35 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2773  transposase IS116/IS110/IS902  43.62 
 
 
385 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1171  transposase IS116/IS110/IS902  40.7 
 
 
379 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0490  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.2 
 
 
383 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0838  putative transposase IS116/IS110/IS902  42.2 
 
 
383 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00974886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3938  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.5 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3520  putative transposase  43.37 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.09 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2565  transposase IS116/IS110/IS902  28.8 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101667  normal  0.0135142 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7352  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.23 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.153369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7565  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.23 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  0.243917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06779  hypothetical protein  23.85 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2832  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.510423  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0848  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4629  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1276  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1119  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4559  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1285  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1231  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2081  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3399  transposase  27.39 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1848  transposase  27.13 
 
 
391 aa  86.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0154372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1131  transposase  27.13 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7433  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.32 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0515465  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.02 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2172  ISCps8, transposase  23.43 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4092  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.78 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.293783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  26.19 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2794  IS111A/IS1328/IS1533/IS116/IS110/IS902 transposase  27.53 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0474  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.66 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599215 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5358  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.4 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  29.71 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1215  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.27 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2811  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.27 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6239  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25.78 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.900844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3058  transposase IS116/IS110/IS902  26.88 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.116967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  25.85 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3759  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.75 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.076485  normal  0.271017 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3506  hypothetical protein  27.36 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.194292  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4035  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.75 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.327975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2272  transposase IS116/IS110/IS902  26.88 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0142849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0234  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.94 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  25 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  28.42 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3207  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.53 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0807  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.53 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.71 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.71 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6141  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.71 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0240  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.71 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.828436  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.92 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.5 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  26.3 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.13 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4120  transposase IS116/IS110/IS902  29.1 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0499  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.37 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2285  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.37 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.607967 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5061  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.37 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0269335 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.6 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  28.06 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1559  transposase for IS1663  25.51 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0007  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.75 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.84 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0439  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
369 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1192  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
369 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1680  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.2 
 
 
369 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1233  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.16 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3996  transposase IS116/IS110/IS902  28.38 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4003  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.428142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3734  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.01 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1121  transposase IS116/IS110/IS902  28.07 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.07 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  27.94 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  26.33 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.56 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4556  transposase IS116/IS110/IS902  25.5 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0733262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>